110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3603 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  85.98 
 
 		 371 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  85.44 
 
 		 371 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  100 
 
 		 371 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  79.51 
 
 		 369 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  72.16 
 
 		 370 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  70.49 
 
 		 369 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  69.73 
 
 		 370 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  69.19 
 
 		 370 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  70.51 
 
 		 373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  47.67 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  45.23 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  46.43 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  49.56 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  43.6 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  46.28 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  38.36 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40.74 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  36.36 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  36.04 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  35.23 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.23 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.23 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  36.78 
 
 		 206 aa  67  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  35.79 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  33.72 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.49 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  32.18 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  34.41 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  34.41 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  37.35 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  34.41 
 
 		 203 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  38.36 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  34.15 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  34.88 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.79 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  32.97 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  32.95 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  35.11 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  33.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  35.11 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  30 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  31.87 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  32.56 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  35.82 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  40.62 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  33.33 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  28.38 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  31.76 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  36.84 
 
 		 582 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  28.1 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  32.5 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35 
 
 		 269 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  38.27 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  32.93 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  29.21 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  36.51 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  29.07 
 
 		 202 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  30.11 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  28.95 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  32 
 
 		 205 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  28.99 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  36.11 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  30.34 
 
 		 205 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  36.62 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  25.89 
 
 		 467 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.63 
 
 		 112 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  25.97 
 
 		 212 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2833  hypothetical protein  32.84 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000539183  normal  0.0320979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  31.75 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  29.87 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  33.8 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.33 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  29.87 
 
 		 466 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  35.38 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  29.41 
 
 		 215 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  32.93 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  33.73 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2439  hypothetical protein  28.92 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35.09 
 
 		 115 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  29.87 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  34.78 
 
 		 239 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  34.29 
 
 		 221 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  31.82 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  34.78 
 
 		 239 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  34.29 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  25 
 
 		 190 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  33.33 
 
 		 240 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  33.33 
 
 		 242 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  34.78 
 
 		 239 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>