63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2439 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  34.65 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.78 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  29.69 
 
 		 405 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.78 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.65 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  28.28 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.14 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  30.49 
 
 		 370 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  30 
 
 		 370 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  33.33 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  29.79 
 
 		 390 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  31.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  28.57 
 
 		 859 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.73 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  29.07 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  29.27 
 
 		 370 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  33.72 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  32.47 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  31.03 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  32.56 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  30 
 
 		 369 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  31.03 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  36.11 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  31.11 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  33.75 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  33.78 
 
 		 397 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  30.23 
 
 		 206 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  32.56 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  35 
 
 		 403 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.39 
 
 		 391 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.33 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  39.34 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  31.4 
 
 		 207 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  31.4 
 
 		 207 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  32.14 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  28.92 
 
 		 371 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  31.25 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.79 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  27.71 
 
 		 363 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  30.23 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  32.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  29.31 
 
 		 248 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  33.33 
 
 		 392 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  35 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  26.25 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  31.82 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.41 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.39 
 
 		 467 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  27.42 
 
 		 227 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  31.08 
 
 		 342 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1916  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.024506  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  31.67 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  31.82 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  29.76 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.87 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  29.07 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  29.07 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  29.07 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>