176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1244 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  33.33 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  58.24 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  47.66 
 
 
283 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  45.45 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  33.96 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  32.74 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.08 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  44.74 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  42.05 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.24 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  44.3 
 
 
117 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.32 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.71 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.5 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  36.05 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.33 
 
 
112 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.23 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  38.82 
 
 
212 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  41.67 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  25 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.27 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  37.08 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  37.08 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.21 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30.63 
 
 
193 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.96 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  28.77 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.29 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.5 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  35.23 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.65 
 
 
259 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  41.18 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  34.12 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  40.26 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  37.66 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
582 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.14 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.52 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  37.65 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  34.48 
 
 
275 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  34.48 
 
 
275 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  35.29 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  37.04 
 
 
223 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.25 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  36 
 
 
447 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.84 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  26.52 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.53 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  36.36 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  41.56 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  36.84 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  31.33 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  37.66 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  35.9 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.8 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  30.56 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  30.56 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  35.71 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  32.56 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  32.56 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  36.05 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  35.71 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.14 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  35.71 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  39.76 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  32.56 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  29.21 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  32.56 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  39.51 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  24.73 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  35.71 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  36.78 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  36.9 
 
 
277 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  34.67 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  36.9 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  36.78 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  31.03 
 
 
565 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  34.62 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  33.33 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  37.5 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  35.06 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  35.06 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.44 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  31.82 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  37.66 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  37.18 
 
 
184 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  28.11 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.75 
 
 
441 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  31.82 
 
 
255 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  31.03 
 
 
273 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  30.65 
 
 
204 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  37.35 
 
 
270 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  30 
 
 
121 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.21 
 
 
295 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  32.89 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  30.68 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.94 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  33.33 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>