17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4650 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  100 
 
 
292 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  46.55 
 
 
269 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  29.83 
 
 
443 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.9 
 
 
1888 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.68 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  27.57 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.67 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  43.55 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  41.82 
 
 
447 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  34.67 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  37.62 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  30.3 
 
 
444 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  34.55 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  41.94 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  35.53 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  37.93 
 
 
489 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  40.68 
 
 
484 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>