18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1224 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1224  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0740153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.76 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  33.01 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  33.01 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.75 
 
 		 137 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  38.75 
 
 		 137 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  38.46 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  38.46 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  35 
 
 		 138 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  30 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  30 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  35.06 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  27.27 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  32.53 
 
 		 413 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  32.56 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  34.92 
 
 		 507 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.47 
 
 		 249 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  30.14 
 
 		 215 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>