100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2065 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  36.19 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  36.63 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  40.66 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  40.54 
 
 		 277 aa  64.7  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  38.89 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.63 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.5 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  34.07 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  33.64 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  37.11 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.13 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  36.26 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  31.25 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.13 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.13 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  33.68 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  38.57 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  32.97 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  37.84 
 
 		 451 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.81 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.94 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.26 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  29.19 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.59 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  29.61 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.77 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  33.7 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  28.07 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  36 
 
 		 272 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  37.5 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  33.33 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  27.06 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  31.03 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.44 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  32.5 
 
 		 336 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.23 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.33 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  32.58 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  35.96 
 
 		 284 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.43 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  34.67 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  29.47 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  35.9 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  28.26 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  30.12 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  31.91 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  36.49 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  38.33 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  28.92 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  32.97 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.21 
 
 		 324 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.14 
 
 		 276 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  36.49 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  26.09 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33.33 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  27.64 
 
 		 279 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  32.58 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  26.71 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  34.88 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  32.22 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  29.76 
 
 		 249 aa  45.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  31.25 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  28.74 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  30.95 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  36 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  42 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  31.25 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  29.23 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  31.25 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  27.52 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  34.57 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  31.08 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.5 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  26.26 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  35 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  33.75 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  31.08 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  30.43 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  33.73 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  36 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  33.75 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  35.06 
 
 		 274 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  35.8 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  33.73 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  30.08 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  35 
 
 		 233 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  41.3 
 
 		 507 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  34.15 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  35.06 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  35 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  35.06 
 
 		 291 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  35.9 
 
 		 286 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  35.8 
 
 		 221 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  30.53 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  40 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  25.89 
 
 		 266 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.94 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  36 
 
 		 245 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>