22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2072 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1323  hypothetical protein  55.46 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.329029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2960  hypothetical protein  53.78 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.999469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  39.57 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1699  TonB-dependent receptor, putative  36.4 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  32.95 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  30.97 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  38.24 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  35.29 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  40 
 
 		 88 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  28.76 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.82 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  38.46 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  42.86 
 
 		 342 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.96 
 
 		 411 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  42.86 
 
 		 342 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  40.38 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  32.89 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  33.33 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  27.07 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  33.78 
 
 		 294 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  24.51 
 
 		 282 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>