13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2960 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2960  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.999469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1323  hypothetical protein  93.88 
 
 		 245 aa  362  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.329029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  38.06 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  34.01 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1699  TonB-dependent receptor, putative  29.08 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  26.2 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  28.82 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  27.78 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  40 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  30.59 
 
 		 88 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  40.38 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  27.78 
 
 		 324 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4555  TonB-like protein  25.84 
 
 		 369 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248985  normal  0.0574394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>