18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0587 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  100 
 
 
324 aa  644    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  29.47 
 
 
276 aa  89  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0860  protein TolA  29.24 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000165303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  32.65 
 
 
163 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  52.94 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf221  hypothetical lipoprotein  65.12 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000001977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  31.88 
 
 
317 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf220  hypothetical lipoprotein  43.93 
 
 
280 aa  47  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000054375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  25.93 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  33.33 
 
 
3472 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.33 
 
 
3471 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  31.43 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  31.43 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  38.26 
 
 
3521 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.22 
 
 
588 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00745561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2960  hypothetical protein  27.78 
 
 
245 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.999469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  22.42 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  22.03 
 
 
246 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>