43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0381 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  100 
 
 		 231 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  70.78 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  71.23 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  67.25 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  67.25 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  67.25 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  57.14 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  62.84 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  57.26 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  54.71 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  52.63 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  39.07 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  54.76 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  40.24 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  36.59 
 
 		 668 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  51.16 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.16 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  38.96 
 
 		 485 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  25.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  58 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  31.91 
 
 		 447 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  36.84 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  28.18 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34.12 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  36.71 
 
 		 489 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  34.57 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  35.8 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  35.21 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.59 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  26.7 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  47.06 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.89 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  33.9 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  38.3 
 
 		 438 aa  42.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.78 
 
 		 2179 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.38 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  25 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  34.67 
 
 		 215 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.78 
 
 		 2272 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  26.81 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  26.81 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  31.51 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>