47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6361 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  90.56 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  74.79 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  75.64 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  66.11 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  66.67 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  64.84 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  65.79 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  54.37 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  45.83 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  48.94 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  39.29 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34.12 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.93 
 
 		 668 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  32.53 
 
 		 485 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36.84 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  39.13 
 
 		 371 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  36.14 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.66 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  31.91 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  28.57 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  41.03 
 
 		 413 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  37.68 
 
 		 371 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  35.37 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  36.84 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.1 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  38 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.88 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  33.93 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  26.83 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.89 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.89 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  30.2 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  25 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  34 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.16 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  28.79 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35 
 
 		 115 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  27.47 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  34.62 
 
 		 565 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  30.86 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  38.1 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  24.89 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  32.35 
 
 		 242 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>