17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3235 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  100 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  34.53 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  40.09 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  38.6 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  39.64 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  34.82 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  38.01 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  36.77 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  39.11 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  39.11 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  39.11 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  31.96 
 
 		 833 aa  48.5  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  43.86 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  32.69 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  39.58 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  39.29 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  38.3 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>