20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1758 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  53.21 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  48.25 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  35.96 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  37.33 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  51.06 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  43.88 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  48.94 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  48.94 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  48.94 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  48.94 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  48.94 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  46.81 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31 
 
 		 2449 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  48.84 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  38.78 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.18 
 
 		 1049 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1482 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.12 
 
 		 1888 aa  42.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  35.29 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>