145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1836 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 524 aa  1072    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  57.53 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  32.72 
 
 		 647 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  33.56 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  33.55 
 
 		 621 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  30.13 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  29.52 
 
 		 601 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  32.42 
 
 		 672 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  32.45 
 
 		 563 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  31.05 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  30.32 
 
 		 604 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  28.48 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  28 
 
 		 583 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  32.14 
 
 		 624 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  28.52 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  27.42 
 
 		 668 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  30.23 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  27.66 
 
 		 379 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  27.99 
 
 		 506 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  28.92 
 
 		 804 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  23.21 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  25.68 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  23.95 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  44.71 
 
 		 1053 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  37.98 
 
 		 1049 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  26.88 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.27 
 
 		 417 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  22.03 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  24.05 
 
 		 754 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1150 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1117 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1034 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1155 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  23.89 
 
 		 858 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1114 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  41.41 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  29.28 
 
 		 728 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.79 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  40.66 
 
 		 1041 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  40.58 
 
 		 1127 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  25.98 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1105 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1116 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  39.56 
 
 		 1079 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 1028 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1161 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  28.79 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1128 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  43.28 
 
 		 1038 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1063 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 994 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 996 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1098 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1000 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1076 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 1080 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1064 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1177 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1041 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  46.27 
 
 		 1128 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 988 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  37.97 
 
 		 1024 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 976 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  38.55 
 
 		 1032 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1038 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1043 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  39.76 
 
 		 1006 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 		 1120 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1186 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32 
 
 		 1018 aa  47  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1079 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1074 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1076 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  43.28 
 
 		 1124 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  37.97 
 
 		 1177 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  40.51 
 
 		 1096 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  40.24 
 
 		 1155 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1143 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1037 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 1033 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  25.91 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  25.91 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 986 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  44.12 
 
 		 1034 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1039 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 1144 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  40.26 
 
 		 1103 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1076 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1129 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 1163 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1033 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1202 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 1030 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1106 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1008 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>