69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2099 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
614 aa  1261    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  56.41 
 
 
322 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  53.11 
 
 
462 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  52.15 
 
 
728 aa  335  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  48.29 
 
 
719 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0162  hypothetical protein  62.79 
 
 
174 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  38.68 
 
 
210 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  38.42 
 
 
754 aa  147  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  30.09 
 
 
302 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  28.4 
 
 
747 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  27.52 
 
 
442 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  24.3 
 
 
858 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  24.81 
 
 
647 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1474  hypothetical protein  66.18 
 
 
81 aa  97.1  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25.13 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  25.75 
 
 
750 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  24.29 
 
 
465 aa  94.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  28.44 
 
 
397 aa  93.6  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  26.08 
 
 
617 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  24.01 
 
 
629 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  24.01 
 
 
629 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.43 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.86 
 
 
619 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.52 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  22.73 
 
 
640 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  26.23 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  24.37 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  26.64 
 
 
519 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  22.45 
 
 
585 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  22.45 
 
 
585 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  22.45 
 
 
585 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.98 
 
 
589 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  33.66 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.78 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  34.81 
 
 
299 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  28.39 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  28.63 
 
 
403 aa  66.6  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  29.88 
 
 
598 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  29.94 
 
 
541 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  30.82 
 
 
423 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  25 
 
 
557 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  26.34 
 
 
631 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  25.42 
 
 
660 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  31.9 
 
 
361 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  31.96 
 
 
590 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  26.02 
 
 
672 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  27.71 
 
 
651 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  24.69 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  29.65 
 
 
631 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  25.42 
 
 
467 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  28.8 
 
 
438 aa  50.8  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  35.45 
 
 
596 aa  50.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  37.04 
 
 
447 aa  50.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  30.05 
 
 
467 aa  50.4  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  28.44 
 
 
581 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  32.95 
 
 
477 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  29.55 
 
 
750 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  25 
 
 
649 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  22.39 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  23.11 
 
 
1122 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  25.89 
 
 
529 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  26.4 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  25.55 
 
 
585 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2323  penicillin binding protein  56.14 
 
 
72 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  26.19 
 
 
563 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  29.73 
 
 
465 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  23.58 
 
 
601 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  31.9 
 
 
270 aa  43.9  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  22.61 
 
 
585 aa  43.9  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>