50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3888 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 631 aa  1283    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1122 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  31.17 
 
 		 664 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  28.65 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  23.98 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  28.26 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  24.44 
 
 		 671 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  34.95 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.87 
 
 		 660 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 1991 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  24.07 
 
 		 541 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  24.04 
 
 		 728 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  27.61 
 
 		 438 aa  53.9  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.01 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  25.42 
 
 		 719 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  32.23 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  22.93 
 
 		 754 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 598 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  22.49 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  29.65 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  24.49 
 
 		 700 aa  50.8  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  39.34 
 
 		 447 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.72 
 
 		 750 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  23.63 
 
 		 529 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  30.63 
 
 		 581 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  25.42 
 
 		 583 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  27.27 
 
 		 472 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  25.2 
 
 		 596 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  23.03 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  26.47 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  31.18 
 
 		 596 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  27.4 
 
 		 413 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  36.62 
 
 		 442 aa  47.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  21.57 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0114  hypothetical protein  32.84 
 
 		 211 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  32.59 
 
 		 913 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4243  hypothetical protein  32.84 
 
 		 166 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0115  hypothetical protein  34.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0110  hypothetical protein  34.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  21.62 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  23.23 
 
 		 477 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  36.36 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  21.62 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  21.62 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  23.56 
 
 		 379 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0112  hypothetical protein  29.81 
 
 		 204 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.651869 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  24.82 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  30 
 
 		 465 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  27.18 
 
 		 668 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  28.43 
 
 		 750 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>