35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5967 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 621 aa  1277    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  31.34 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  32.39 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  32.13 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  33.97 
 
 		 529 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  33.65 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  29.97 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  30.15 
 
 		 672 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  29.19 
 
 		 647 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  29.39 
 
 		 438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  28.07 
 
 		 668 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  30.74 
 
 		 624 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  27.54 
 
 		 506 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.44 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  27.89 
 
 		 583 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  30.94 
 
 		 467 aa  107  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  32.78 
 
 		 804 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  28.32 
 
 		 413 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  28.05 
 
 		 472 aa  93.6  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  24.56 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  29.59 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  27.67 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  27.11 
 
 		 462 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.2 
 
 		 397 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  28.49 
 
 		 413 aa  50.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  36.61 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.2 
 
 		 719 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  43.86 
 
 		 447 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  26.29 
 
 		 322 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  25.91 
 
 		 728 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  34 
 
 		 590 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  25.29 
 
 		 379 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  23.81 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.27 
 
 		 632 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1122 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>