60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00308 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 314 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  32.4 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  31.71 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  30.7 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  25.93 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  29.5 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  27.97 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  28.81 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  24.05 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  28.81 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  28.81 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  28.81 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  27.12 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  27.97 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  28.81 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  31.21 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  29.06 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 		 431 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  27.78 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  28.81 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  27.52 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  27.52 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  36.61 
 
 		 621 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  27.18 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  27.52 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  36.92 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2852  peptidase M48, Ste24p  26.71 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  33.33 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  26.04 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1813  HtpX domain protein  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  26.04 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  24.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  36.92 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  37.74 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  27.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  27.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  27.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  27.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  27.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  35.06 
 
 		 397 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  35.38 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  35.38 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  27.22 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1784  heat shock protein HtpX  23.53 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000381435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3742  heat shock protein HtpX  42.59 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3023  heat shock protein HtpX  42.59 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1674  heat shock protein HtpX  23.53 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00952626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  32.41 
 
 		 529 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2748  heat shock protein HtpX  29.41 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.459812  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2662  heat shock protein HtpX  23.53 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000479868  hitchhiker  0.00874622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  29.9 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1034  heat shock protein HtpX  36.84 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>