128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  35.16 
 
 
328 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  43.45 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  25.69 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  28.98 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  37.58 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  26.96 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  28.26 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  27.49 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  29.11 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0968  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  38.64 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  27.38 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  27.38 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  37.3 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  37.3 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  28.38 
 
 
307 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  36.45 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  32.74 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  40.28 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  40.62 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  32.22 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  35.63 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  34.21 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  31.54 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  31.54 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  31.54 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  38.64 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1860  peptidase M48 Ste24p  34.82 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  34.82 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1947  peptidase M48 Ste24p  46.3 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  41.56 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  41.27 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  33.93 
 
 
299 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  25.39 
 
 
298 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  37.93 
 
 
292 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  45.76 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 
307 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  31.15 
 
 
268 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  39.74 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  35.14 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  28.66 
 
 
307 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  36.05 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  39.74 
 
 
300 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  40.3 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  28.16 
 
 
285 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  35.9 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  29.17 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  29.17 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  40.3 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  31.72 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  32.73 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  35.53 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  28.32 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  35.53 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  28.42 
 
 
279 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  35.56 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  38.14 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  30.26 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  35.48 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  34.78 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  34.09 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  41.07 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  38.16 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  38.46 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  32.71 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  32.93 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  37.31 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  32.14 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  27.52 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2766  peptidase M48 Ste24p  35.65 
 
 
431 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  27.18 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  27.18 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  33.77 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2952  peptidase M48 Ste24p  41.54 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.77 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  22.28 
 
 
671 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  35 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  42.11 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  34.85 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  34.85 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>