More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2314 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  100 
 
 		 397 aa  802    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  74 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  71.67 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  69.85 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  69.43 
 
 		 378 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  66.92 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  68.36 
 
 		 387 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  42.43 
 
 		 339 aa  257  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  39.39 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  39.33 
 
 		 294 aa  209  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  37.5 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  33.03 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  32.35 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  32.02 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  36.54 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  31.27 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.31 
 
 		 296 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  31.23 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  33.43 
 
 		 298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  32.82 
 
 		 292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  34.63 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  35 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  36.12 
 
 		 289 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  32.06 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  34.24 
 
 		 294 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  33.64 
 
 		 312 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  34.98 
 
 		 289 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  32.18 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  32.72 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  36.54 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  34.66 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.63 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  34.07 
 
 		 279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  35.88 
 
 		 284 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  34.24 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  33.59 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  29.46 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  33.21 
 
 		 307 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 282 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0453  heat shock protein HtpX  27.62 
 
 		 339 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  27.33 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.56 
 
 		 285 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  33.58 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  35.06 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  33.21 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  30.83 
 
 		 287 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  32.35 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  34.87 
 
 		 287 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  30.4 
 
 		 315 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  30.89 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  34.48 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.82 
 
 		 286 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  31.13 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 		 282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  31.25 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  31.23 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  37.01 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 		 282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 289 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  31.15 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 		 280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  32.57 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  31.61 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  31.39 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  32.02 
 
 		 292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  31.33 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  33.2 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  32.43 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  34.69 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  29.38 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  32.25 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  35.23 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  30.92 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  29.85 
 
 		 281 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  34.57 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  34.57 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  31.66 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  34.57 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  34.57 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  34.57 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  33.74 
 
 		 293 aa  126  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  32.41 
 
 		 297 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2058  HtpX domain protein  32.68 
 
 		 294 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000452797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  29.7 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  32.01 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  32.01 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>