More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  100 
 
 
287 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  73.59 
 
 
286 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  74.3 
 
 
286 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  69.61 
 
 
296 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  67.72 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  68.42 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  68.42 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  68.42 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  68.66 
 
 
292 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  65.49 
 
 
290 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  62.37 
 
 
293 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  70.59 
 
 
274 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  62.81 
 
 
290 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  62.81 
 
 
303 aa  359  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  65.84 
 
 
283 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  64.41 
 
 
283 aa  352  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  66.55 
 
 
289 aa  349  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  65.84 
 
 
284 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  63.7 
 
 
289 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  63.23 
 
 
294 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  62.99 
 
 
306 aa  332  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  57.59 
 
 
289 aa  330  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  58.89 
 
 
285 aa  326  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  63.05 
 
 
282 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  60.56 
 
 
299 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  61.17 
 
 
295 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  58.99 
 
 
278 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  56.25 
 
 
289 aa  295  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  50.53 
 
 
282 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  50.69 
 
 
312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  49.82 
 
 
296 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  48.1 
 
 
285 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  47.87 
 
 
285 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  49.47 
 
 
285 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  48.41 
 
 
285 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  48.41 
 
 
285 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  48.76 
 
 
285 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  48.76 
 
 
285 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  48.76 
 
 
285 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  47.87 
 
 
306 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  47.5 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  46.64 
 
 
288 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  47.87 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  46.98 
 
 
279 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  46.81 
 
 
286 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  47.16 
 
 
286 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  46.81 
 
 
286 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  47.69 
 
 
282 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  46.44 
 
 
296 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  45.74 
 
 
280 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  51.06 
 
 
308 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  45.58 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  46.59 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  46.26 
 
 
282 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  47.83 
 
 
328 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  45.26 
 
 
282 aa  241  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  55.36 
 
 
287 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  47.04 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  47.02 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  44.13 
 
 
279 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  44.17 
 
 
320 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  44.52 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  44.09 
 
 
279 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  44.84 
 
 
286 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  47.15 
 
 
296 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  46.64 
 
 
281 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  45.66 
 
 
285 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  44.98 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  49.44 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  47.18 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  46.83 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  46.89 
 
 
287 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  44.64 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  47.16 
 
 
280 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  44.64 
 
 
280 aa  231  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  47.16 
 
 
280 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  44.94 
 
 
286 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  49.45 
 
 
307 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  45.74 
 
 
318 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  43.73 
 
 
285 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  44.09 
 
 
285 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  45.04 
 
 
325 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  45.04 
 
 
325 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  44.68 
 
 
313 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  43.37 
 
 
285 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  44.68 
 
 
321 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  45.42 
 
 
287 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  45.98 
 
 
289 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  44.88 
 
 
319 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  44.33 
 
 
279 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>