More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0236 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  64.63 
 
 
292 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  64.65 
 
 
297 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  62.93 
 
 
291 aa  371  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  61.56 
 
 
291 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  52.98 
 
 
304 aa  330  3e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  52.19 
 
 
294 aa  298  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  51.53 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  53.24 
 
 
294 aa  277  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  49.31 
 
 
299 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  51.18 
 
 
293 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  49.32 
 
 
292 aa  267  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  50.51 
 
 
290 aa  266  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  47.46 
 
 
301 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  48.99 
 
 
310 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  48.16 
 
 
297 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  47.33 
 
 
320 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  46.42 
 
 
292 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  43.23 
 
 
317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  48.81 
 
 
295 aa  238  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  44.22 
 
 
309 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  41.67 
 
 
296 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  42.62 
 
 
309 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  44.48 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2230  heat shock protein HtpX  43.23 
 
 
322 aa  216  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  39.2 
 
 
307 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  41.09 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  39.49 
 
 
292 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  41.76 
 
 
312 aa  192  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  40.43 
 
 
286 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  41.79 
 
 
291 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  43.53 
 
 
295 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  41.79 
 
 
291 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  41.79 
 
 
291 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  41.04 
 
 
289 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  42.21 
 
 
283 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1861  peptidase M48 Ste24p  41.38 
 
 
292 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  42.36 
 
 
296 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  37.91 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  42.8 
 
 
287 aa  188  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  43.55 
 
 
287 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  41.22 
 
 
291 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  42.38 
 
 
296 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  43.95 
 
 
287 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  40.94 
 
 
280 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  41.09 
 
 
296 aa  185  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  40.93 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  40.58 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  41.9 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  40.08 
 
 
306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  40.14 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  40.48 
 
 
287 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  42.5 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  40.62 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  38.52 
 
 
325 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  38.62 
 
 
284 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  38.52 
 
 
325 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  38.16 
 
 
321 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  37.77 
 
 
290 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  37.82 
 
 
278 aa  182  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 
274 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  38.79 
 
 
303 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  39.05 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  39.92 
 
 
289 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  38.87 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  39.43 
 
 
320 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  41.8 
 
 
285 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  37.68 
 
 
286 aa  178  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  38.27 
 
 
283 aa  178  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  37.72 
 
 
283 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  39.93 
 
 
282 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 
292 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  40.38 
 
 
308 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  40.56 
 
 
285 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  39.07 
 
 
315 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  41.37 
 
 
282 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  42.74 
 
 
285 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  37.54 
 
 
289 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  39.43 
 
 
320 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  43.19 
 
 
294 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  40.65 
 
 
306 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  39.69 
 
 
285 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  39.69 
 
 
285 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  42 
 
 
285 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  39.67 
 
 
284 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  40.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  39.69 
 
 
285 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  39.84 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  36.11 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  36.97 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>