More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0406 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
306 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  96.54 
 
 
289 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  68.55 
 
 
283 aa  381  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  67.26 
 
 
283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  65.96 
 
 
284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  66.31 
 
 
290 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  64.06 
 
 
290 aa  352  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  62.63 
 
 
292 aa  348  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  67.04 
 
 
274 aa  342  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  62.07 
 
 
296 aa  342  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  62.99 
 
 
287 aa  341  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  63.57 
 
 
286 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  62.5 
 
 
289 aa  338  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  61.81 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  61.81 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  61.81 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  58.51 
 
 
293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  57.24 
 
 
289 aa  328  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  58.51 
 
 
285 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  57.8 
 
 
303 aa  324  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  58.3 
 
 
292 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  63.7 
 
 
282 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  59.79 
 
 
299 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  59.38 
 
 
294 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  58.01 
 
 
286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  56.34 
 
 
289 aa  298  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  54.2 
 
 
296 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  54.48 
 
 
285 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  53.41 
 
 
285 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  57.09 
 
 
278 aa  290  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  53.76 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  53.41 
 
 
285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  51.97 
 
 
285 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  53.41 
 
 
286 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  50.51 
 
 
306 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  52.33 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  53.05 
 
 
286 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  51.97 
 
 
285 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  51.97 
 
 
285 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  51.97 
 
 
285 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  52.69 
 
 
286 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  51.44 
 
 
283 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  56.25 
 
 
295 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  51.61 
 
 
285 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  51.61 
 
 
285 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  51.25 
 
 
288 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  51.43 
 
 
285 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  52.33 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  52.14 
 
 
280 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  50.17 
 
 
312 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  50.18 
 
 
287 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  50.71 
 
 
282 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  51.75 
 
 
296 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  48.92 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  49.65 
 
 
285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  50.53 
 
 
285 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  49.31 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  51.69 
 
 
296 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  50.7 
 
 
284 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  48.94 
 
 
286 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  50.35 
 
 
284 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  48.91 
 
 
279 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  53.05 
 
 
280 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  49.66 
 
 
318 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  50.57 
 
 
285 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  52.69 
 
 
280 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  46.43 
 
 
320 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  50.81 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  46.92 
 
 
319 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  46.83 
 
 
313 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  45.71 
 
 
320 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  48.68 
 
 
286 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  48.4 
 
 
280 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  49.12 
 
 
294 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  46.62 
 
 
279 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  46.48 
 
 
328 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  44.8 
 
 
280 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  44.8 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  45.36 
 
 
279 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  46.95 
 
 
282 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  50.36 
 
 
283 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  49.13 
 
 
308 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  49.81 
 
 
287 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  45.2 
 
 
282 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  48.68 
 
 
285 aa  235  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  49.29 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  46.83 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  46.83 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  47.9 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  46.48 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  50.57 
 
 
295 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  48.4 
 
 
281 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  44.8 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  49.82 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>