More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0946 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  83.16 
 
 
286 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  71.83 
 
 
283 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  65.12 
 
 
281 aa  345  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  62.12 
 
 
285 aa  345  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  61.22 
 
 
286 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  59.93 
 
 
282 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  68.18 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  61.94 
 
 
287 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  60.07 
 
 
287 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  60.63 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  54.64 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  60.85 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  60.14 
 
 
284 aa  310  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  58.8 
 
 
285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  53.05 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  58.17 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  58.78 
 
 
280 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  58.42 
 
 
280 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  53.19 
 
 
285 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  53.17 
 
 
306 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  52.61 
 
 
287 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  54.64 
 
 
294 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  58.3 
 
 
295 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  52.28 
 
 
285 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  49.83 
 
 
296 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  50.71 
 
 
284 aa  292  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  51.58 
 
 
285 aa  291  6e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  54.64 
 
 
294 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  51.58 
 
 
285 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  51.06 
 
 
285 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  54.93 
 
 
308 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  51.06 
 
 
296 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  55.4 
 
 
297 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  50.35 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  52.11 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  49.48 
 
 
285 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  50 
 
 
285 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  50 
 
 
285 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  50 
 
 
285 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  50 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  50 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  49.65 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  50 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  48.94 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  49.48 
 
 
296 aa  278  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  51.12 
 
 
296 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.5 
 
 
282 aa  275  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  48.78 
 
 
283 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  51.41 
 
 
286 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  51.06 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  50.35 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  49.12 
 
 
280 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  52.52 
 
 
283 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  49.1 
 
 
288 aa  271  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  53.18 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  50.53 
 
 
318 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  47 
 
 
280 aa  268  8e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  51.25 
 
 
285 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  50.89 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  49.3 
 
 
279 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  46.29 
 
 
280 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  50.71 
 
 
290 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  49.64 
 
 
290 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  51.3 
 
 
281 aa  261  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  49.1 
 
 
279 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  48.06 
 
 
320 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
287 aa  258  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  48.58 
 
 
316 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  49.63 
 
 
307 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  47.86 
 
 
299 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  48.06 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  44.44 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  52 
 
 
279 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  47.48 
 
 
342 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  47.7 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  48.39 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  47.54 
 
 
307 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  47.18 
 
 
321 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  47.35 
 
 
325 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  47.35 
 
 
286 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  47.35 
 
 
325 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  47.49 
 
 
291 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  45.61 
 
 
292 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  49.08 
 
 
274 aa  248  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  48.43 
 
 
299 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  48.41 
 
 
284 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  49.28 
 
 
281 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  48.75 
 
 
315 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  49.82 
 
 
280 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  47 
 
 
300 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  47 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  45.58 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>