More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6655 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  74.3 
 
 		 287 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  67.96 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  65.72 
 
 		 291 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  65.72 
 
 		 291 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  65.72 
 
 		 291 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  63.6 
 
 		 292 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  64.66 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  62.11 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  63.25 
 
 		 292 aa  351  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  59.51 
 
 		 290 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  59.65 
 
 		 303 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  57.89 
 
 		 290 aa  338  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  61.21 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  62.9 
 
 		 289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  66.02 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  61.22 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  62.32 
 
 		 283 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  61.97 
 
 		 284 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  53.12 
 
 		 289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  58.25 
 
 		 285 aa  311  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  58.8 
 
 		 299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  58.01 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  58.01 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  60.32 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  56.79 
 
 		 278 aa  288  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  54.86 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  51.06 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  58.22 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  46.23 
 
 		 312 aa  254  9e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  45.74 
 
 		 285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  46.45 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  45.94 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  45.74 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  45.74 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  45.39 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  46.29 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  46.64 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  45.04 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  45.04 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  44.68 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  45.94 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  45.23 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  45.07 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  54.39 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  45.39 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  44.72 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  44.13 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  43.49 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  49.45 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  44.29 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  45.08 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  41.64 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  47.33 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  40.62 
 
 		 285 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  44.88 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  42.05 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  45.15 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  42.45 
 
 		 279 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  42.61 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  48.41 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  41.99 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  41.55 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  44.37 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  43.75 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  41.64 
 
 		 288 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  41.2 
 
 		 320 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  43.46 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  43.46 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  40.85 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  40.99 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  43.35 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  46.32 
 
 		 307 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  41.28 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  43.02 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  44.28 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  40.43 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  44.33 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  40.43 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  39.36 
 
 		 279 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  43.97 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  38.38 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  44.4 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  43.54 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  49.79 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 		 307 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  43.62 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  46.5 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  42.14 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  41.84 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  44.06 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>