More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3243 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  71.16 
 
 
286 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  71.8 
 
 
285 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  71.83 
 
 
284 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  71.83 
 
 
284 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  70.57 
 
 
287 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  70.94 
 
 
287 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  68.21 
 
 
280 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  67.14 
 
 
280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  71.83 
 
 
285 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  70.08 
 
 
285 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  59.35 
 
 
279 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  60.78 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  60.42 
 
 
287 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  62.55 
 
 
283 aa  332  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  57.14 
 
 
285 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  58.42 
 
 
285 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  59.35 
 
 
282 aa  331  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  59.09 
 
 
296 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  60.14 
 
 
285 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  60.14 
 
 
285 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  59.44 
 
 
285 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  60.14 
 
 
285 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  60.14 
 
 
285 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  58.74 
 
 
285 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  59.79 
 
 
285 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  59.09 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  57.14 
 
 
286 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  59.79 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  59.79 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  56.18 
 
 
296 aa  325  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  60.78 
 
 
286 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  59.64 
 
 
283 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  57.89 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  62.74 
 
 
280 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  58.72 
 
 
285 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  56.64 
 
 
288 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  60.49 
 
 
286 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  59.79 
 
 
286 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  57.19 
 
 
320 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  58.3 
 
 
280 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  60.35 
 
 
286 aa  314  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  57.04 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  60.57 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  58.99 
 
 
279 aa  309  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  55.3 
 
 
296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  57.14 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  54.06 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  53.57 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  64.52 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  55.56 
 
 
279 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  56.94 
 
 
313 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  56.43 
 
 
307 aa  298  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  56.23 
 
 
287 aa  295  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  57.45 
 
 
325 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  57.45 
 
 
325 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  56.38 
 
 
319 aa  294  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  54.68 
 
 
318 aa  294  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  54.09 
 
 
316 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  56.38 
 
 
342 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  56.74 
 
 
321 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  57.3 
 
 
285 aa  292  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  55.09 
 
 
294 aa  291  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  52.11 
 
 
343 aa  290  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  55.12 
 
 
317 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  54.55 
 
 
296 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  54.23 
 
 
297 aa  289  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  54.77 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  54.7 
 
 
299 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  54.77 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  54.45 
 
 
293 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  55 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  54.07 
 
 
307 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  52.14 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  55.04 
 
 
292 aa  281  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  51.79 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  56.49 
 
 
324 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  51.42 
 
 
284 aa  279  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  51.17 
 
 
291 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  51.72 
 
 
294 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  52.5 
 
 
287 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  48.75 
 
 
290 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  47.87 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  55.78 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  55.6 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  48.94 
 
 
288 aa  271  6e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  53.24 
 
 
281 aa  271  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  54.09 
 
 
307 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  55.32 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  50.9 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  50.18 
 
 
285 aa  268  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  50.53 
 
 
285 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  50.18 
 
 
285 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>