More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0503 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  74.26 
 
 
303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  77.78 
 
 
289 aa  441  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  73.17 
 
 
285 aa  428  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  68.77 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  72.76 
 
 
295 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  69.9 
 
 
294 aa  374  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  67.13 
 
 
289 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  69.86 
 
 
278 aa  362  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  62.9 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  61.75 
 
 
290 aa  339  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  59.87 
 
 
296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  58.74 
 
 
312 aa  334  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  61.05 
 
 
292 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  60.92 
 
 
287 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  59.57 
 
 
290 aa  329  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  60.42 
 
 
291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  60 
 
 
306 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  60.42 
 
 
291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  60.69 
 
 
286 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  60.42 
 
 
291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  60.99 
 
 
283 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  59.79 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  64.03 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  58.95 
 
 
289 aa  318  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  58.36 
 
 
283 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  58.13 
 
 
292 aa  315  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  58.8 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  63.87 
 
 
282 aa  298  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  48.93 
 
 
285 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  49.31 
 
 
296 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  48.57 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  49.12 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  48.21 
 
 
286 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  47.86 
 
 
286 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  46.59 
 
 
283 aa  258  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  48.21 
 
 
286 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  46.43 
 
 
288 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  47.86 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  51.05 
 
 
308 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  47.7 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  47.69 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  49.82 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  47.86 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  46.85 
 
 
279 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  46.1 
 
 
285 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  47.79 
 
 
287 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  44.48 
 
 
280 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  43.46 
 
 
285 aa  235  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  49.09 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  43.82 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  45.96 
 
 
287 aa  232  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  44.68 
 
 
320 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  49.25 
 
 
285 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  43.66 
 
 
286 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  46.79 
 
 
285 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  42.91 
 
 
279 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  43.21 
 
 
279 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  45.8 
 
 
285 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  44.37 
 
 
320 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  48.21 
 
 
328 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  46.07 
 
 
286 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  42.36 
 
 
316 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  45.7 
 
 
296 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  49.82 
 
 
307 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  47.55 
 
 
281 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  49.8 
 
 
280 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  44.1 
 
 
296 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  48.54 
 
 
287 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  42.96 
 
 
313 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  42.35 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  44.01 
 
 
287 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  48.18 
 
 
287 aa  221  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  45 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  51.67 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  52.3 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  49.8 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  49.21 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  47.71 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  46.83 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  45.83 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
309 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0007  peptidase, M48 family  39.66 
 
 
292 aa  218  7e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  41.67 
 
 
315 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  46.81 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  41.31 
 
 
343 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>