More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0144 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  100 
 
 
281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  59.07 
 
 
313 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  57.5 
 
 
320 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  60.57 
 
 
282 aa  322  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  58.57 
 
 
283 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  56.79 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  59.93 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  58.57 
 
 
306 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  60.57 
 
 
342 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  57.54 
 
 
285 aa  317  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  58.95 
 
 
285 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  315  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  58.57 
 
 
319 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  57.54 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  55.67 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  58.25 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  59.64 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  59.64 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  59.64 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  58.01 
 
 
280 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  57.54 
 
 
285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  57.54 
 
 
285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  55.67 
 
 
307 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  58.93 
 
 
287 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  56.18 
 
 
300 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  56.99 
 
 
279 aa  308  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  56.18 
 
 
300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  57.45 
 
 
315 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  59.64 
 
 
286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  57.14 
 
 
286 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  59.29 
 
 
286 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  55.36 
 
 
288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  59.29 
 
 
286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  53.38 
 
 
343 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  56.77 
 
 
285 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  55.79 
 
 
287 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  53.68 
 
 
299 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  56.98 
 
 
286 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  53.93 
 
 
280 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  56.47 
 
 
279 aa  295  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  53.57 
 
 
280 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  54.42 
 
 
307 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  55.79 
 
 
298 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  54.17 
 
 
296 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  56.07 
 
 
280 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  51.41 
 
 
285 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  53.87 
 
 
310 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  57.79 
 
 
280 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  52.31 
 
 
286 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  52.11 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  55.71 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  56.07 
 
 
324 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  51.94 
 
 
285 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  56.32 
 
 
316 aa  284  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  53.71 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  56.15 
 
 
295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  58.56 
 
 
287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  53.79 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  52.5 
 
 
282 aa  281  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  47 
 
 
282 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  55.79 
 
 
284 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 
283 aa  278  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  58.98 
 
 
285 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  54.93 
 
 
284 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  57.41 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  50.18 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  52.26 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  51.43 
 
 
279 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  54.58 
 
 
294 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  54.89 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  59.25 
 
 
285 aa  268  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  49.64 
 
 
290 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  52.46 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  49.1 
 
 
283 aa  262  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  52.28 
 
 
309 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  47.89 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  52.81 
 
 
285 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  49.47 
 
 
286 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  48.41 
 
 
296 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  47 
 
 
291 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  47 
 
 
291 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  47 
 
 
291 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  50.36 
 
 
318 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  54.72 
 
 
279 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  49.14 
 
 
296 aa  256  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  47.5 
 
 
293 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  49.29 
 
 
284 aa  254  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  48.56 
 
 
290 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  47.2 
 
 
289 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>