More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3406 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  95.8 
 
 		 286 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  86.76 
 
 		 296 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  87.32 
 
 		 285 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  86.27 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  86.97 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  86.62 
 
 		 285 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  85.92 
 
 		 285 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  85.92 
 
 		 285 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  88.11 
 
 		 286 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  88.11 
 
 		 286 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  88.46 
 
 		 286 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  81.65 
 
 		 283 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  76.14 
 
 		 288 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  76.79 
 
 		 280 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  71.38 
 
 		 279 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  66.19 
 
 		 279 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  61.48 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  61.13 
 
 		 320 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  59.93 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  62.01 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  62.01 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  60.65 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  61.65 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  58.84 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  60.79 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  61.42 
 
 		 286 aa  315  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  56.74 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  59.22 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  62.31 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  56.38 
 
 		 280 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  60.78 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  60.57 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  60.42 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  59.29 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  59.86 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  56.54 
 
 		 343 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  56.47 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  57.35 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  57.35 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  58.57 
 
 		 281 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  58.12 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  55.63 
 
 		 298 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  53.17 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  60.52 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  52.82 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  58.66 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  56.38 
 
 		 299 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  60.89 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  59.43 
 
 		 280 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  54.67 
 
 		 294 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  56.38 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  62.35 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  59.62 
 
 		 285 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  58.72 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  54.84 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  55.33 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  51.07 
 
 		 288 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  52.46 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  58.02 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  54.17 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  57.19 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  58.65 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  50.52 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  55.94 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  58.27 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  50 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  55.06 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  51.79 
 
 		 283 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  55.76 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  53.05 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  50.52 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  49.29 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  53.56 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  50.51 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  53.71 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  50.54 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  51.33 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  50.68 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  51.61 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  53.36 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  50.35 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  50 
 
 		 296 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  49.64 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  47.5 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  48.96 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  48.75 
 
 		 279 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  48.61 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>