More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1776 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  76.14 
 
 
306 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  75.35 
 
 
296 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  73.94 
 
 
285 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  73.94 
 
 
285 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  73.59 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  73.94 
 
 
285 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  73.94 
 
 
285 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  73.94 
 
 
285 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  72.89 
 
 
285 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  75.9 
 
 
283 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  73.24 
 
 
285 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  73.24 
 
 
285 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  74.74 
 
 
286 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  75.09 
 
 
286 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  75.44 
 
 
286 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  75.09 
 
 
286 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  72.86 
 
 
280 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  64.39 
 
 
279 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  65.22 
 
 
279 aa  362  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  55.87 
 
 
320 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  55.16 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  55.48 
 
 
282 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  55.04 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  55.04 
 
 
319 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  57.3 
 
 
286 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  52.9 
 
 
294 aa  295  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  53.76 
 
 
300 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  53.76 
 
 
300 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  53.33 
 
 
313 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  56.34 
 
 
285 aa  292  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  53.38 
 
 
299 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  54.84 
 
 
342 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  52.67 
 
 
280 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  53.38 
 
 
283 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  53.76 
 
 
282 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  53.41 
 
 
287 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  52.71 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  54.12 
 
 
325 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  54.12 
 
 
325 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  52.31 
 
 
280 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  55.67 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  55.67 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  54.92 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  53.41 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  53.58 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  52.16 
 
 
307 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  53.05 
 
 
317 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  50.71 
 
 
288 aa  280  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  54.61 
 
 
309 aa  278  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  54.8 
 
 
280 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  50.87 
 
 
343 aa  275  5e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  49.82 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  54.09 
 
 
280 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  49.1 
 
 
285 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  50.69 
 
 
287 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  50.35 
 
 
282 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  55.76 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  50.54 
 
 
307 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  50.36 
 
 
283 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  50 
 
 
298 aa  268  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  52.33 
 
 
316 aa  268  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  51.26 
 
 
315 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  54.24 
 
 
287 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  52.52 
 
 
310 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  49.82 
 
 
296 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  46.53 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  54.34 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  51.25 
 
 
306 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  49.81 
 
 
296 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  47.5 
 
 
279 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  53.91 
 
 
285 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  50.89 
 
 
289 aa  261  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  47.54 
 
 
285 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  48.61 
 
 
292 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  51.09 
 
 
286 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  49.83 
 
 
297 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  49.47 
 
 
286 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  52.29 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  52.36 
 
 
282 aa  258  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  46.15 
 
 
290 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  47.59 
 
 
296 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  48.08 
 
 
291 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  48.08 
 
 
291 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  48.08 
 
 
291 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  54.51 
 
 
280 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  47.37 
 
 
312 aa  255  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  50 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  44.56 
 
 
289 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  50.18 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  45.71 
 
 
303 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  49.44 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>