More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1928 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  89.86 
 
 		 296 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  59.86 
 
 		 294 aa  318  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  55.29 
 
 		 287 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  54.42 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  59.86 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  52.96 
 
 		 285 aa  308  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  56.54 
 
 		 295 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  54.61 
 
 		 285 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  54.72 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  57.75 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  53.95 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  53.47 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  54.17 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  53.26 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  56.62 
 
 		 287 aa  295  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  51.38 
 
 		 286 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  53.53 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  53.47 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  51.89 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  53.47 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  54.86 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  55.51 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  53.12 
 
 		 285 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  53.12 
 
 		 285 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  53.12 
 
 		 285 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  52.78 
 
 		 296 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  52.78 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  53.12 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  49.83 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  56.4 
 
 		 297 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  53.02 
 
 		 282 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  50 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  56.03 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  56.38 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  53.12 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  53.12 
 
 		 286 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  55.29 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  52.08 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  54.06 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  53.71 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  48.61 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  53.82 
 
 		 279 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  52.13 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  51.56 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  51.66 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  51.93 
 
 		 279 aa  272  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  54.61 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  54.74 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  50 
 
 		 343 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  48.11 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  48.24 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  50.17 
 
 		 280 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  50.88 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  52.11 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  49.48 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.53 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  47.06 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  50.7 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  49.65 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  50.35 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  50.7 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  50.7 
 
 		 320 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  52.08 
 
 		 292 aa  261  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  51.41 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  51.41 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  52.1 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  52.1 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  49.31 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  52.8 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  51.4 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  50 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  47.4 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  51.75 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  48.28 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  50.88 
 
 		 281 aa  256  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  50.88 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  47.24 
 
 		 285 aa  254  9e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  51.05 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  47.24 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  45.8 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  51.31 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  51.4 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  51.31 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  49.83 
 
 		 289 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  49.3 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  48.78 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  50.71 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  50.7 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  50.77 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  45.8 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>