More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1935 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  97.54 
 
 		 284 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  85.66 
 
 		 286 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  84.41 
 
 		 285 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  79.51 
 
 		 287 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  79.15 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  74.3 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  74.3 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  71.48 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  80.71 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  77.39 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  61.92 
 
 		 285 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  61.35 
 
 		 279 aa  354  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  69.06 
 
 		 280 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  60.85 
 
 		 282 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  61.57 
 
 		 286 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  62.54 
 
 		 306 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  60.42 
 
 		 285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  60.78 
 
 		 296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  61.48 
 
 		 285 aa  335  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  60.78 
 
 		 285 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  60.93 
 
 		 285 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  62.54 
 
 		 286 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  59.72 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  59.36 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  59.36 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  60.14 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  60.35 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  60.35 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  60.35 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  56.74 
 
 		 296 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  57.89 
 
 		 287 aa  318  9e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  55.48 
 
 		 285 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  57.8 
 
 		 288 aa  315  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  61.13 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  61.13 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  56.99 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  61.48 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  55.94 
 
 		 343 aa  311  7.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  59.01 
 
 		 280 aa  308  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  56.29 
 
 		 320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  58.42 
 
 		 283 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  56.6 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  57.09 
 
 		 279 aa  305  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  55.56 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  57.75 
 
 		 297 aa  302  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  55.67 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  56.29 
 
 		 319 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  55.09 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  55.09 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  54.74 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  56.51 
 
 		 285 aa  295  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  57.65 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  55.87 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  56.87 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  55.73 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  51.41 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  55.99 
 
 		 342 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  53.68 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  54.42 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  55.59 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  55.91 
 
 		 318 aa  289  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  53.87 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  52.98 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  53.33 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  60.8 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  52.98 
 
 		 307 aa  284  9e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  53.17 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  54.58 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  55.63 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  52.3 
 
 		 290 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  54.44 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  54.42 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  51.23 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  51.06 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  51.94 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  52.48 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  51.92 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  54.51 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  50.88 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  53.85 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  50.53 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  52.46 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  47.2 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  54.04 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  55.91 
 
 		 307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  51.93 
 
 		 307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  55.12 
 
 		 286 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  55.02 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>