More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0969 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  98.57 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  72.79 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  75.95 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  77.14 
 
 		 287 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  76.79 
 
 		 287 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  80.29 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  72.89 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  72.18 
 
 		 284 aa  387  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  66.79 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  71.43 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  61.07 
 
 		 282 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  67.68 
 
 		 280 aa  348  6e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  59.14 
 
 		 279 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  59.86 
 
 		 286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  58.78 
 
 		 285 aa  334  9e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  58.72 
 
 		 285 aa  325  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  58.72 
 
 		 306 aa  325  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  58.72 
 
 		 285 aa  324  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  58.01 
 
 		 296 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  58.36 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  58.36 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  58.6 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  58.01 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  58.01 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  58.01 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  57.3 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  55.36 
 
 		 285 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  60.29 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  58.72 
 
 		 286 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  54.48 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  57.45 
 
 		 285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  54.09 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  54.68 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  57.65 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  57.14 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  57.65 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  55.24 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  59.01 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  57.6 
 
 		 280 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  53.71 
 
 		 296 aa  298  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  53.21 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  54.96 
 
 		 294 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  58.11 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  53.71 
 
 		 297 aa  294  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  58.46 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  54.29 
 
 		 279 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  57.86 
 
 		 281 aa  292  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  57.91 
 
 		 283 aa  291  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  55.12 
 
 		 317 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  53.57 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  61.13 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  54.64 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  52.14 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  54.29 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  54.29 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  53.21 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  51.79 
 
 		 280 aa  288  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  51.77 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  54.12 
 
 		 279 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  53.93 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  54.17 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  54.32 
 
 		 281 aa  285  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  51.6 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  52.14 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  52.84 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  52.67 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  48.93 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  50.9 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  52.31 
 
 		 286 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  51.06 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  53.21 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  51.77 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  54.96 
 
 		 294 aa  279  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  54.45 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  53.02 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  54.44 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  53.21 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  51.24 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  51.24 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  52.67 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  54.8 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  51.06 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  57.6 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  50.18 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  56.18 
 
 		 307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  56 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  52.21 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  49.1 
 
 		 293 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  52.36 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  52.69 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>