More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2673 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  100 
 
 
328 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  57.45 
 
 
287 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  50.53 
 
 
284 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  50.9 
 
 
283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  48.57 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  47.46 
 
 
287 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  46.64 
 
 
290 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  49.29 
 
 
286 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  52.21 
 
 
282 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  48.59 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  47.54 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  46.98 
 
 
289 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  48.21 
 
 
286 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  47.33 
 
 
290 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  47.52 
 
 
292 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  47.86 
 
 
296 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  45.55 
 
 
291 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  45.55 
 
 
291 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  45.55 
 
 
291 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  45.23 
 
 
283 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  46.18 
 
 
303 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  47.01 
 
 
274 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  52.34 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  48.25 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  45.21 
 
 
285 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  43.46 
 
 
292 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  41.99 
 
 
279 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  43.86 
 
 
289 aa  222  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  39.86 
 
 
312 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  37.1 
 
 
285 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  38.11 
 
 
285 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  43.88 
 
 
282 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  37.88 
 
 
296 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  37.06 
 
 
285 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  40.62 
 
 
296 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  42.24 
 
 
278 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  37.72 
 
 
285 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  37.72 
 
 
285 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  37.37 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  39.1 
 
 
285 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  37.06 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  37.06 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  37.06 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  44.17 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  37.01 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  37.01 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  37.28 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  37.77 
 
 
279 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  39.47 
 
 
286 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  37.86 
 
 
282 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  36.92 
 
 
286 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  36.1 
 
 
283 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  45.49 
 
 
295 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  39.22 
 
 
285 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  37.37 
 
 
286 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  40.53 
 
 
295 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  36.65 
 
 
306 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  36.3 
 
 
280 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  40.82 
 
 
296 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  40.78 
 
 
280 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  38.75 
 
 
287 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  34.64 
 
 
288 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  36.88 
 
 
285 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  37.24 
 
 
294 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  40.5 
 
 
283 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  38.71 
 
 
313 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  37.68 
 
 
279 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 
296 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  35.59 
 
 
286 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  37.18 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
282 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  36.43 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  39.77 
 
 
289 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  38.2 
 
 
287 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  35.48 
 
 
320 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  36.88 
 
 
288 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  36.9 
 
 
294 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  36.82 
 
 
285 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  36.46 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  37.01 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  36.33 
 
 
307 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  39.77 
 
 
289 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  34.53 
 
 
316 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  33.69 
 
 
280 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  37.37 
 
 
318 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  34.77 
 
 
320 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  32.97 
 
 
280 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  37.5 
 
 
294 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  36.19 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  38.43 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  36.65 
 
 
280 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  36.1 
 
 
285 aa  172  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>