More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0660 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  72.41 
 
 		 303 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  73.79 
 
 		 289 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  65.98 
 
 		 289 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  67.93 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  68.4 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  66.32 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  64.26 
 
 		 283 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  67.01 
 
 		 295 aa  352  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  63.23 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  66.08 
 
 		 278 aa  346  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  59.45 
 
 		 292 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  59.45 
 
 		 296 aa  342  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  61.22 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  67.46 
 
 		 282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  58.42 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  58.28 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  58.89 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  56.75 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  56.75 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  56.75 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  56.4 
 
 		 290 aa  322  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  57.64 
 
 		 292 aa  321  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  59.66 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  59.38 
 
 		 306 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  59.03 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  62.35 
 
 		 274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  55.33 
 
 		 283 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  54.14 
 
 		 312 aa  304  9.000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  50.17 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  47.55 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  47.02 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  55.6 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  45.45 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  46.15 
 
 		 285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  46.18 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  45.3 
 
 		 280 aa  244  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  46.15 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  46.15 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  46.15 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  46.48 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  46.85 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  46.5 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  45.8 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  45.8 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  45.8 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  46.85 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  44.76 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  45.96 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  44.41 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  45.1 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  43.94 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  44.98 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  45.45 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  47.71 
 
 		 286 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  43.55 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  47.55 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  46.69 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  45.42 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  43.9 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  42.07 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  45.83 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  44.79 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  44.63 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  46.69 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  45.76 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  46.34 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  41.55 
 
 		 316 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  46.69 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  47.62 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  52.81 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  45.7 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  42.01 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  46.1 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  47.88 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  48.06 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  41.92 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  46.18 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  46.74 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  42.61 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  42.86 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  46.12 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  45.1 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  52.61 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  51.95 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  45.49 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  45.1 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  42.36 
 
 		 320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  41.67 
 
 		 320 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  48.56 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  47.11 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  45.21 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>