More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1103 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 292 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  69.79 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  69.79 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  69.79 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  70.42 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  67.71 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  69.26 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  70.42 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  63.96 
 
 		 286 aa  352  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  62.9 
 
 		 283 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  57.93 
 
 		 303 aa  335  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  59.36 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  57.04 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  60.35 
 
 		 284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  57.3 
 
 		 293 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  58.3 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  62.04 
 
 		 274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  56.29 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  57.8 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  58.68 
 
 		 294 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  55.56 
 
 		 289 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  59.36 
 
 		 289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  58.3 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  58.8 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  55.83 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  55.59 
 
 		 289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  49.82 
 
 		 282 aa  282  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  51.03 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  54.98 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  49.3 
 
 		 296 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  48.94 
 
 		 285 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  49.3 
 
 		 285 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  47.89 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  47.54 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  46.83 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  47.18 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  47.18 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  47.18 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  48.21 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  47.02 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  49.83 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  45.42 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  47.39 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  47.2 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  46.85 
 
 		 286 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  46.67 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  44.17 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  45.1 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  43.99 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  45.74 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  42.81 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  44.64 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  49.12 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  45 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  44.76 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  46.48 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  47.48 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  44.33 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  43.94 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  42.46 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  44.21 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  44.91 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  44.91 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  44.17 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  44.56 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  42.81 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  43.46 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  46.15 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  43.45 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  44.21 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  45.8 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  44.84 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  45.66 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  42.96 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  42.61 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  45.7 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  43.77 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  43.97 
 
 		 287 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  44.03 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  43.42 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  48.59 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  43.34 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  45.07 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  44.56 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  45.42 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  43.06 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  40.61 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  49 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  45.16 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  44.84 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>