More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4537 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  70.66 
 
 
287 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  64.66 
 
 
290 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  67.3 
 
 
289 aa  352  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  66.92 
 
 
306 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  66.17 
 
 
292 aa  347  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  67.04 
 
 
284 aa  347  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  65.92 
 
 
296 aa  345  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  63.7 
 
 
283 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  64.71 
 
 
286 aa  339  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  62.03 
 
 
290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  63.7 
 
 
283 aa  334  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  61.57 
 
 
293 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  62.17 
 
 
291 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  62.17 
 
 
291 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  62.17 
 
 
291 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  65.34 
 
 
282 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  63.33 
 
 
289 aa  320  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  63.06 
 
 
303 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  63.74 
 
 
286 aa  319  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  58.71 
 
 
289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  61.03 
 
 
292 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  62.45 
 
 
299 aa  299  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  58.7 
 
 
294 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  58.96 
 
 
285 aa  292  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  59.33 
 
 
289 aa  281  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  56.99 
 
 
278 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  53.36 
 
 
285 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  52.52 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
285 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  58.39 
 
 
295 aa  271  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  52.61 
 
 
296 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  50.55 
 
 
282 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  49.08 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  52.24 
 
 
285 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  51.87 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  51.87 
 
 
286 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  47.99 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  52.24 
 
 
286 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  52.24 
 
 
286 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  51.69 
 
 
287 aa  260  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  51.49 
 
 
285 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  51.49 
 
 
285 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  50.75 
 
 
285 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  51.49 
 
 
285 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  51.12 
 
 
285 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  51.12 
 
 
285 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  51.12 
 
 
285 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  51.87 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  50.38 
 
 
283 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  49.43 
 
 
285 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  48.87 
 
 
286 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  48.71 
 
 
288 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  50.19 
 
 
287 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  46.86 
 
 
286 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  53.01 
 
 
285 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  51.49 
 
 
286 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  49.81 
 
 
280 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  52.36 
 
 
280 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  47.46 
 
 
296 aa  249  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  52.36 
 
 
280 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  48.68 
 
 
295 aa  248  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  49.81 
 
 
280 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  49.25 
 
 
282 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  49.43 
 
 
281 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  47.79 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  48.5 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  47.58 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  51.29 
 
 
284 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  47.81 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  49.44 
 
 
285 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  51.29 
 
 
284 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  49.44 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  46.15 
 
 
294 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  51.79 
 
 
292 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  45.76 
 
 
320 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  48.74 
 
 
318 aa  236  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  47.79 
 
 
296 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
283 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.3 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  48.85 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  46.67 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  44.85 
 
 
320 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  47.51 
 
 
291 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  47.66 
 
 
325 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  50.2 
 
 
279 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  47.66 
 
 
325 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  48.87 
 
 
283 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  47.27 
 
 
321 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  48.35 
 
 
294 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  47.01 
 
 
328 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  51.57 
 
 
307 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  44.69 
 
 
316 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>