More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2532 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  100 
 
 
309 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2230  heat shock protein HtpX  78.34 
 
 
322 aa  441  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  68.33 
 
 
301 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  65.45 
 
 
320 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  66 
 
 
296 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  69.77 
 
 
302 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  60.98 
 
 
306 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  57.05 
 
 
317 aa  344  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  60.07 
 
 
307 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  54.58 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1861  peptidase M48 Ste24p  56.31 
 
 
292 aa  302  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  51.82 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  51.68 
 
 
287 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  48.33 
 
 
294 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  52.48 
 
 
299 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  50 
 
 
294 aa  285  7e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  53.54 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  49.83 
 
 
290 aa  275  6e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  48.84 
 
 
292 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  47.83 
 
 
293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  48.03 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  45.79 
 
 
297 aa  258  8e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  45.97 
 
 
292 aa  251  8.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  44.55 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  42.62 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  42.28 
 
 
291 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  42.28 
 
 
292 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  44.27 
 
 
314 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  43.3 
 
 
286 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  39.04 
 
 
283 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  41.1 
 
 
312 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  35.2 
 
 
304 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  37.76 
 
 
286 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  40.45 
 
 
285 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  39.18 
 
 
287 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  38.28 
 
 
280 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  37.93 
 
 
295 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  38.85 
 
 
285 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  35.49 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  39.02 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  36.62 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  39.38 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  39.46 
 
 
287 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  40.23 
 
 
287 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  38.28 
 
 
289 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  40.16 
 
 
280 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  37.74 
 
 
296 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  41.08 
 
 
308 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  37.54 
 
 
286 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  37.41 
 
 
313 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 
292 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  32.99 
 
 
282 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  36.04 
 
 
285 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  38.01 
 
 
342 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  38.19 
 
 
284 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  36.4 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  38.98 
 
 
280 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  35.79 
 
 
285 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  35.17 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  39.59 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  38.38 
 
 
320 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  37.98 
 
 
282 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  36.59 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  37.1 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  36.73 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  36.73 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  38.19 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  36.24 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  35.27 
 
 
285 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  36.39 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  35.54 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  38.95 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  34.86 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  34.84 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  36.33 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  38.81 
 
 
291 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  37.89 
 
 
290 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  35.54 
 
 
285 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  35.54 
 
 
285 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  35.54 
 
 
285 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  35.11 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  34.26 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  37.98 
 
 
279 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  35.46 
 
 
285 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  35.52 
 
 
284 aa  162  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  37.55 
 
 
296 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  40.24 
 
 
286 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  37.72 
 
 
303 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  38.06 
 
 
283 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  35.66 
 
 
307 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  34.92 
 
 
285 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 
296 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  39.15 
 
 
278 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  35.74 
 
 
279 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>