More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3151 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  57 
 
 
301 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  54.98 
 
 
320 aa  331  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  55.88 
 
 
296 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  54.81 
 
 
306 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  54.58 
 
 
309 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  54.92 
 
 
307 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2230  heat shock protein HtpX  53.8 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  48.28 
 
 
317 aa  281  1e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  49.5 
 
 
310 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  47.52 
 
 
287 aa  266  5e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  55.78 
 
 
302 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  48.17 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  47.87 
 
 
299 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  46.2 
 
 
294 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  49.16 
 
 
292 aa  248  8e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  46.13 
 
 
294 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  46.98 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  45.95 
 
 
290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1861  peptidase M48 Ste24p  49.49 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  42.42 
 
 
291 aa  242  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  42.95 
 
 
296 aa  241  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  46.18 
 
 
293 aa  241  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  43.42 
 
 
297 aa  237  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  44.11 
 
 
292 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  43.24 
 
 
292 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  41.08 
 
 
291 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  40.71 
 
 
314 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  37.67 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  39.01 
 
 
287 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  39.73 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  40.15 
 
 
286 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  36.5 
 
 
279 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  38.65 
 
 
283 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  40.08 
 
 
291 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  37.4 
 
 
324 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  38.79 
 
 
283 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  38.23 
 
 
286 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  39.47 
 
 
289 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  39.07 
 
 
282 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  37.54 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  36.16 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  39.62 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  36.8 
 
 
307 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  36.86 
 
 
285 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  37.4 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  40.29 
 
 
280 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  36.18 
 
 
285 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  37 
 
 
279 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  36.52 
 
 
296 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  38.61 
 
 
280 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  38.33 
 
 
289 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  36.96 
 
 
296 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  37.46 
 
 
278 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  36.46 
 
 
320 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  37.36 
 
 
294 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  34.64 
 
 
320 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  35.96 
 
 
285 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  35.84 
 
 
285 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  35.84 
 
 
285 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  35.84 
 
 
285 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  40.25 
 
 
285 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  37.98 
 
 
295 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  33.9 
 
 
313 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  35.49 
 
 
285 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  35.49 
 
 
285 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  36.11 
 
 
306 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  36.81 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  39.76 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  33.9 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  36.18 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  34.69 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  38.89 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  38.08 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  37.6 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  40.32 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  36.08 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  38.7 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  37.23 
 
 
286 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  36.61 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  36.61 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  38.43 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  38.43 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  35.56 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  38.43 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  40.82 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  37.2 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  34.72 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  36.65 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  37.69 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  33.9 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>