More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0648 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  52.98 
 
 
296 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  51.64 
 
 
292 aa  305  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  51.79 
 
 
297 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  50.66 
 
 
291 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  49.51 
 
 
291 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  43.79 
 
 
294 aa  226  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  42.72 
 
 
287 aa  225  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  42.86 
 
 
294 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  49.03 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  42.57 
 
 
297 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  43.52 
 
 
293 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  41.97 
 
 
310 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  42.86 
 
 
292 aa  208  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  40.53 
 
 
290 aa  205  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  37.67 
 
 
309 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  39.74 
 
 
320 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  38.61 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  38.02 
 
 
317 aa  199  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  41.2 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  39.06 
 
 
301 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  37.46 
 
 
296 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  39.66 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  42.68 
 
 
286 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  40.85 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  38.41 
 
 
279 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  39.58 
 
 
306 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  38.97 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  41.26 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  40.79 
 
 
285 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  42.15 
 
 
285 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  39.24 
 
 
286 aa  178  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  38.97 
 
 
286 aa  178  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  41.94 
 
 
274 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  40.07 
 
 
285 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  37.93 
 
 
292 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  39.86 
 
 
320 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  39.93 
 
 
286 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  40.28 
 
 
285 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  40.28 
 
 
285 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  39.45 
 
 
285 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  39.93 
 
 
290 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  39.53 
 
 
280 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  39.25 
 
 
282 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  38.3 
 
 
285 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  40.28 
 
 
285 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  40.28 
 
 
285 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  40.28 
 
 
285 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  40.21 
 
 
325 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  40.21 
 
 
325 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  39.86 
 
 
296 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  40.56 
 
 
319 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  40.28 
 
 
285 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  39.53 
 
 
280 aa  175  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  41.15 
 
 
287 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  35.2 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  43.7 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  43.27 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  38.49 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  41.86 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  43.31 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
283 aa  172  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  39.5 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  41.38 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  37.67 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  37.67 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  37.67 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  41.67 
 
 
285 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  39.57 
 
 
282 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  40.8 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  37.89 
 
 
283 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  40.61 
 
 
289 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  40.99 
 
 
303 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  39 
 
 
288 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  37.5 
 
 
287 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  39.26 
 
 
288 aa  170  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  39.27 
 
 
296 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  40.28 
 
 
280 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  39.35 
 
 
287 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  38.38 
 
 
296 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  38.85 
 
 
287 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  39.62 
 
 
290 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  39.84 
 
 
285 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  38.6 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  40.21 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  37.37 
 
 
286 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  39.37 
 
 
286 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  39.37 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  41.37 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  40.42 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  39.07 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  39.68 
 
 
285 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>