More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2840 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  70.21 
 
 
294 aa  425  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  61.03 
 
 
287 aa  364  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  60 
 
 
299 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  56.9 
 
 
297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  54.83 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  53.45 
 
 
291 aa  305  7e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  58.02 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  54.64 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  54.61 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  56.46 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  50.17 
 
 
301 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  56.55 
 
 
292 aa  295  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  53.24 
 
 
296 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  51.03 
 
 
291 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  51.03 
 
 
292 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  49.32 
 
 
320 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  50.51 
 
 
306 aa  289  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  49.67 
 
 
309 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  52.25 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  47.9 
 
 
317 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  47.42 
 
 
296 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2230  heat shock protein HtpX  47.1 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  50.17 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  48.33 
 
 
307 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  47.14 
 
 
309 aa  248  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  44.19 
 
 
304 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1861  peptidase M48 Ste24p  44.14 
 
 
292 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  38 
 
 
314 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  43.62 
 
 
295 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  40.66 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  41.39 
 
 
283 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  41.49 
 
 
324 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  40.62 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  41.37 
 
 
317 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  38.32 
 
 
307 aa  178  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  44.07 
 
 
291 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  39.01 
 
 
316 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  41.6 
 
 
280 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  40.33 
 
 
279 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  41.6 
 
 
280 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  44.21 
 
 
286 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  40.33 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  40.33 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  39.08 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  44.21 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  41.6 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  41.49 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  40.33 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  43.51 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  38.75 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  42.04 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  38.73 
 
 
316 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  42.68 
 
 
285 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  41 
 
 
320 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  38.03 
 
 
286 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  37.14 
 
 
286 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  40.4 
 
 
280 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  41.84 
 
 
286 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  38.38 
 
 
343 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  39.84 
 
 
285 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1286  peptidase M48 Ste24p  40.2 
 
 
295 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  37.32 
 
 
286 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  39.75 
 
 
306 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  39.09 
 
 
285 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  44.49 
 
 
285 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  39.31 
 
 
285 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  37.76 
 
 
296 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  41.74 
 
 
307 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  40.17 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  35.97 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  40.34 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  39.92 
 
 
285 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  38.55 
 
 
285 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  35.82 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  35.82 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  36.96 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  36.96 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  35.82 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  38.59 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  36.46 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  40 
 
 
320 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  38.93 
 
 
285 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  41.98 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  37.81 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  38.91 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  41.18 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  37.75 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  39.18 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  40.91 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  39 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>