More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2230 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2230  heat shock protein HtpX  100 
 
 		 322 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  78.98 
 
 		 309 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  65.58 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  61.69 
 
 		 320 aa  391  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  63.64 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  58.41 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  58.58 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  66.23 
 
 		 302 aa  338  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  57.28 
 
 		 307 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  54.75 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1861  peptidase M48 Ste24p  54.82 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  47.1 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  48.06 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  49.84 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  51.13 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  46.69 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  49.35 
 
 		 295 aa  265  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  49.02 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  45.57 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  45.31 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  45.6 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  45.21 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  42.05 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  42.14 
 
 		 291 aa  242  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  45.03 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  44.52 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  41.97 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  43.12 
 
 		 314 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  42.21 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  34.85 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  41.41 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  39.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  37.2 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  38.72 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  40.71 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  35.79 
 
 		 283 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  40.48 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.21 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  36.86 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  38.89 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  35.08 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  33.67 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  38.32 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  33.67 
 
 		 285 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  37.85 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  37.09 
 
 		 292 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  35.69 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  39 
 
 		 280 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  38.52 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  34.92 
 
 		 284 aa  159  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  39.27 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  40.42 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  38.8 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  39.76 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  35.55 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  37.04 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  34.62 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  39.22 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  35.9 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  36.46 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  38.1 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  34.32 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  35.14 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  36.21 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  33.45 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  36.77 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  34.88 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  34.88 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 		 283 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  36.12 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  39.53 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  34.77 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  36.22 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  35.52 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  34.45 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  35.08 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  34.13 
 
 		 285 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  34.24 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  36.43 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  33.79 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  39.31 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  36.77 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  36.67 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  34.13 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>