More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0242 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  63.44 
 
 		 282 aa  329  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  57.75 
 
 		 287 aa  322  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  54.68 
 
 		 282 aa  314  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  61.07 
 
 		 285 aa  308  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  54.68 
 
 		 285 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  60.93 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  58.71 
 
 		 286 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  53.21 
 
 		 286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  60.22 
 
 		 280 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  59.77 
 
 		 287 aa  298  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  55.32 
 
 		 306 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  59.4 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  58.66 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  61.26 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  58.16 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  51.43 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  57.82 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  60 
 
 		 285 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  53.87 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  52.1 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  55.6 
 
 		 295 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  55.32 
 
 		 286 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  52.48 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  52.84 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  53.19 
 
 		 285 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  54.61 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  54.26 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  54.26 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  51.94 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  55.6 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  51.43 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  51.07 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  51.42 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  54.2 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  51.77 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  52.13 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  52.13 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  52.13 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  52.13 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  52.13 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  51.77 
 
 		 285 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  48.94 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  48.75 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  51.77 
 
 		 284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  52.61 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  48.39 
 
 		 280 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  49.65 
 
 		 320 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  54.44 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  51.07 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  52.08 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  52.67 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  51.8 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  49.65 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  53.73 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  47.86 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  51.11 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  51.43 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  51.43 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  48.06 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  47.35 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  50.18 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  49.82 
 
 		 279 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  51.43 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  49.65 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  48.64 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  48.94 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  49.65 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  49.82 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  50 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  50.53 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  49.29 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  51.77 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  51.08 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  48.94 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  51.79 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  50.18 
 
 		 309 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  47.31 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  51.6 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  48.23 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  48.4 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  49.02 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  49.11 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  53.64 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  50.2 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  46.81 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  45.52 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  50.53 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  48.77 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  48.77 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  48.92 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>