More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4314 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 388 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  79.85 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  81.8 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  71.58 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  73.4 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  68.44 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  68.9 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  44.28 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  44.32 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  38.32 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  38.61 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  34.15 
 
 		 296 aa  157  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  36.54 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  36.96 
 
 		 297 aa  156  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  31.99 
 
 		 297 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  31.37 
 
 		 296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  33.23 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  35.57 
 
 		 282 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  33.53 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  36.72 
 
 		 296 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  35.94 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  33.96 
 
 		 285 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  29.91 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  33.97 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  32.86 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  35.27 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  35.36 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  32.31 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  33.44 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  33.7 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  32.09 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  32.6 
 
 		 287 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  30.7 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  32.18 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  31.58 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  33.02 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  32.5 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  28.2 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  35.11 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  34.98 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  33.46 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  32.47 
 
 		 306 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  36.26 
 
 		 287 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  34.98 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  31.87 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  31.7 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  34.9 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  33.22 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  32.32 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  37.4 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  35.94 
 
 		 283 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 		 285 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  31.7 
 
 		 289 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  32.7 
 
 		 289 aa  136  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  31.64 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  32.12 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  33.43 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  31.8 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  32.21 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  33.04 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  31.23 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33.45 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  31.78 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  34.41 
 
 		 300 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  30.47 
 
 		 281 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  36.15 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  34.41 
 
 		 300 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  32.56 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  32.8 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  32.96 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  31.48 
 
 		 320 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  30.96 
 
 		 290 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  32.93 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  29.09 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  32.82 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1517  heat shock protein HtpX  32.85 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0660  heat shock protein HtpX  32.85 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  32.82 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  30.53 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30.63 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  33.58 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  34.57 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  35.02 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  30.97 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>