More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1211 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  49.84 
 
 		 294 aa  288  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  45.57 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  39.52 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  37.99 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  37.27 
 
 		 396 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  34.86 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  36.39 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  38.79 
 
 		 397 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  41.51 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  37.13 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  33.97 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  36.93 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  35.42 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  30.97 
 
 		 396 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  32.04 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  37.76 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  35.95 
 
 		 282 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  35.66 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  32.5 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  33.44 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0245  peptidase M48 Ste24p  37.12 
 
 		 655 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  35.97 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  35.11 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  36.22 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  35.57 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  36.21 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1608  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 		 654 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  33.06 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  31.49 
 
 		 664 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  29.29 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  34.11 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  34.8 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  31.49 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  37.96 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  37.96 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  32.82 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  35.17 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  35.51 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  34.77 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  37.61 
 
 		 672 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  39.11 
 
 		 657 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  35.12 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  34.75 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  29.35 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  35.25 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  30.49 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  33.61 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  32.79 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  35.1 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  33.47 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  33.72 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  32.24 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  32.24 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  34.9 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  33.06 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  32.67 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  34.48 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  32.27 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  33.07 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  32.94 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  34.29 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  34.39 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  34.84 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  29.39 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33.59 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  35.43 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  32.99 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  31.98 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  33.74 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  33.73 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3384  peptidase M48 Ste24p  35.39 
 
 		 673 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  31.27 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  31.92 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  31.68 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  33.09 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3448  peptidase M48 Ste24p  34.98 
 
 		 673 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  32.79 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  32.51 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  31.43 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  31.37 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  33.46 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2480  peptidase M48 Ste24p  34.8 
 
 		 661 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  32.8 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>