More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3529 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  49.84 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  39.38 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  43.18 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  42.05 
 
 		 396 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  39.62 
 
 		 383 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  38.52 
 
 		 378 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  38.49 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  38.95 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  38.49 
 
 		 397 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  35.81 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  37.16 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  33.67 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  32.78 
 
 		 396 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  33.57 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  35.66 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  35.21 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  33.8 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  37.1 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  33.93 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  32.18 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  33.45 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  34.72 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  35.1 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  32 
 
 		 397 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  35.76 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  35.29 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  34.22 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  34.28 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  33.22 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  34.95 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  33.22 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  33.22 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  35.69 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  33.22 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  33.57 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  35.54 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  33.1 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  32.86 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  34.21 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  33.45 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  35.19 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  32.98 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  32.14 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  33.92 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  33.45 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  32.06 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  32.31 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  32.58 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  32.26 
 
 		 285 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  32.38 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  30.8 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  31.46 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  34.12 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  37.55 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  34.49 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  33.45 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  32.3 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  34.15 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  33.33 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  32.44 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  32.98 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  30.99 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.9 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  31.82 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  31.54 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  32.48 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  34.14 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  34.51 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  33.8 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  31.56 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  31.9 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  35.25 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  33.8 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  31.77 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  33.8 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  30.69 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>