More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3234 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 387 aa  789    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  75.83 
 
 		 383 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  66.33 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  67.77 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  66.41 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  65.16 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  64.68 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  44.35 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  39.77 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  37.59 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  32.24 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  31.79 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  30.77 
 
 		 296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  30.89 
 
 		 296 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  34.5 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  29.97 
 
 		 304 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  35.27 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  31.64 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  37.3 
 
 		 318 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  34.62 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  35.55 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  35.06 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  32.97 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  34.75 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  30.72 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  31.37 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  36.68 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  32.59 
 
 		 288 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  34.32 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  32.97 
 
 		 296 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  34.64 
 
 		 292 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  31.56 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  34.23 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  34.09 
 
 		 307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  34.64 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  31.99 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  34.44 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  34.1 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.75 
 
 		 316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  33.2 
 
 		 280 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  32.23 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  37.02 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  33.53 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  33.57 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  34.17 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  35.88 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  29.06 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  33.66 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  36.18 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  29.66 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  31.27 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 		 298 aa  131  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  30.48 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  37.8 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  36.88 
 
 		 282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  35.02 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  33.82 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.3 
 
 		 286 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  33.96 
 
 		 287 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  35.82 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  31.56 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  35.82 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  32.32 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  31.23 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  30.3 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 		 280 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  34.15 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  31.17 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 		 280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  30.37 
 
 		 285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  30.37 
 
 		 285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  36.18 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  31.8 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  29.96 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  30.42 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  34.9 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  33.45 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 		 297 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  33.43 
 
 		 291 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  31.3 
 
 		 291 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  33.43 
 
 		 291 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  33.43 
 
 		 291 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  30.97 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  30.42 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>