More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2612 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 383 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  77.72 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  65.59 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  67.37 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  63.03 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  65.07 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  65.64 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  42.81 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  40 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  33.94 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  31.58 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  34.78 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  32.42 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  31.46 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  30.86 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  37.15 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  36.72 
 
 		 296 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  33.03 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  36.76 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  29.91 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  34.07 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  35.89 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  36.44 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  34.65 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  35.52 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 		 285 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  34.88 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  34.39 
 
 		 289 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  32.78 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  32.3 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  33.6 
 
 		 289 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  32.99 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  35.83 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  35.21 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  33.46 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  34.88 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.55 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  33.08 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  32.65 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  32.29 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  31.89 
 
 		 282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  35.8 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  29.94 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 		 284 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  32.14 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  33.59 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  30.68 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  33.77 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  33.44 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  33.2 
 
 		 279 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 		 280 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  32.4 
 
 		 282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  33.07 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  34.29 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  30 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  30 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  36.54 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  32.57 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  36.57 
 
 		 296 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  30.84 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  38.79 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  30.7 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  28.96 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  32.77 
 
 		 659 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  32.27 
 
 		 280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  35.55 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  30.28 
 
 		 286 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  32.83 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 		 280 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  30.3 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  32.68 
 
 		 287 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  38.17 
 
 		 303 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  30.15 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  30.74 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  29.96 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  34.51 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  29.51 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  31.91 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  29.73 
 
 		 287 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  32.95 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  26.32 
 
 		 664 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  29.57 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  36.54 
 
 		 282 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30.31 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  31.4 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>