More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0242 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  60.93 
 
 
297 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  58.33 
 
 
296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  54.67 
 
 
296 aa  310  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  57.76 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  40.47 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  47.33 
 
 
295 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  38.28 
 
 
397 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  45.72 
 
 
281 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  41.98 
 
 
285 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  38.93 
 
 
319 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  42.28 
 
 
287 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  41.36 
 
 
306 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  39.42 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  39.54 
 
 
299 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  42.18 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  42.18 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  38.74 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  45.21 
 
 
321 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  44.44 
 
 
325 aa  196  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  44.44 
 
 
325 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  43.51 
 
 
313 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  38.98 
 
 
283 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  37.5 
 
 
397 aa  192  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  37.88 
 
 
282 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  43.43 
 
 
293 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  39.93 
 
 
279 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  42.11 
 
 
290 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  38.97 
 
 
296 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  41.02 
 
 
286 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  38.97 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  38.64 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  39.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  41.54 
 
 
286 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  38.62 
 
 
285 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  37.97 
 
 
285 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  37.97 
 
 
285 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  39.53 
 
 
280 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  44.27 
 
 
280 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  38.62 
 
 
285 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  38.62 
 
 
285 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  38.62 
 
 
285 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  40.34 
 
 
286 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
296 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  40.34 
 
 
286 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  39.8 
 
 
297 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  38.62 
 
 
285 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  38.28 
 
 
285 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  44.4 
 
 
286 aa  185  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  38.98 
 
 
317 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  38.99 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  39.86 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  37.54 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  37.58 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  43.15 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  40.75 
 
 
279 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  42.62 
 
 
287 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  42.05 
 
 
287 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  37.59 
 
 
288 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  39.32 
 
 
286 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  39.58 
 
 
283 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 
285 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  41.58 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  40.7 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  41.61 
 
 
283 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  39.38 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  38.57 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  40.27 
 
 
284 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  39.53 
 
 
279 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  40.41 
 
 
316 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  40 
 
 
320 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  43.67 
 
 
279 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  38.98 
 
 
286 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  38.85 
 
 
285 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  37.97 
 
 
279 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  38.87 
 
 
318 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  43.98 
 
 
280 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  41.24 
 
 
319 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  43.98 
 
 
280 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 
274 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  36.27 
 
 
280 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  40.36 
 
 
285 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  37.97 
 
 
286 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  39.93 
 
 
284 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  36.7 
 
 
280 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  37.73 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  38.43 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  39.33 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  37.73 
 
 
289 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  36.58 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  37.67 
 
 
316 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  39.04 
 
 
288 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  36.27 
 
 
292 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  36.61 
 
 
296 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>