More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1130 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 
305 aa  614  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  40.33 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  38.91 
 
 
299 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  36.01 
 
 
304 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  38.11 
 
 
296 aa  185  7e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  38.73 
 
 
298 aa  183  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  35.41 
 
 
297 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  36.57 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  35.64 
 
 
318 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  34.97 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 
286 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  32.77 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  34.6 
 
 
285 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  36.1 
 
 
397 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  33.67 
 
 
290 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
283 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  36.25 
 
 
396 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  32.76 
 
 
292 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
285 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  33.56 
 
 
291 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  33.56 
 
 
291 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  33.56 
 
 
291 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  33.22 
 
 
303 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  34.01 
 
 
290 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  34.63 
 
 
312 aa  155  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  34.05 
 
 
285 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  35.92 
 
 
397 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  32.09 
 
 
287 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  33 
 
 
287 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  33.98 
 
 
306 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  31.77 
 
 
283 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  32.76 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  36.12 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  30.82 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  34.75 
 
 
296 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  36.56 
 
 
279 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  34.92 
 
 
325 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  34.22 
 
 
286 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  34.92 
 
 
325 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  30.85 
 
 
292 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  30.17 
 
 
289 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  31.35 
 
 
293 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  33.94 
 
 
281 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 
279 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
283 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  34.92 
 
 
321 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 
274 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  34.31 
 
 
299 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 
284 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 
284 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  37.4 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  33.84 
 
 
291 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  30.45 
 
 
278 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  31.23 
 
 
320 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  34.08 
 
 
294 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 
282 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  31.23 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  32.2 
 
 
294 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  30.56 
 
 
330 aa  146  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  30.36 
 
 
282 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  34.51 
 
 
285 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  33.59 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  30.42 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  29.9 
 
 
288 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  33.21 
 
 
287 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  30.56 
 
 
320 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  31.02 
 
 
294 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  32.97 
 
 
287 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
309 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  32.57 
 
 
282 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 
286 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  32.62 
 
 
291 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  29.62 
 
 
286 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  29.97 
 
 
285 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  30.79 
 
 
296 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  33.79 
 
 
287 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 
280 aa  142  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  30.34 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  29.97 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  29.86 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  31.34 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  30.21 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  31.79 
 
 
317 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  31.33 
 
 
343 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  29.62 
 
 
286 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 
297 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  32.51 
 
 
282 aa  140  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  28.62 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  32.3 
 
 
288 aa  139  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>